Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cdk18Q04899 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdk18Q04899 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms