Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Sox12Q04890 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox12Q04890 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms