Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top1Q04750 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top1Q04750 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Top1Q04750 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top1Q04750 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top1Q04750 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top1Q04750 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top1Q04750 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top1Q04750 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top1Q04750 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top1Q04750 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top1Q04750 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top1Q04750 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms