Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cxcr5Q04683 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cxcr5Q04683 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms