Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CkbQ04447 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CkbQ04447 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CkbQ04447 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CkbQ04447 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CkbQ04447 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CkbQ04447 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CkbQ04447 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CkbQ04447 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms