Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Scg2Q03517 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131 ms