Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Tff2Q03404 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tff2Q03404 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms