Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Thbs2Q03350 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms