Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddr1Q03146 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddr1Q03146 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms