Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Col6a2Q02788 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms