Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NfiaQ02780 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NfiaQ02780 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms