Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gjb5Q02739 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gjb5Q02739 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms