Protein–RNA interactions for Protein: Q02525

Zfp39, Zinc finger protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp39Q02525 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Zfp39Q02525 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zfp39Q02525 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms