Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VcpQ01853 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VcpQ01853 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VcpQ01853 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VcpQ01853 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VcpQ01853 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VcpQ01853 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VcpQ01853 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms