Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nme2Q01768 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Nme2Q01768 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms