Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
EgfrQ01279 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
EgfrQ01279 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms