Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pde1bQ01065 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pde1bQ01065 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms