Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Rbp1Q00915 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rbp1Q00915 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms