Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbp4Q00724 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbp4Q00724 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbp4Q00724 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbp4Q00724 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbp4Q00724 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbp4Q00724 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbp4Q00724 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rbp4Q00724 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rbp4Q00724 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rbp4Q00724 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rbp4Q00724 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rbp4Q00724 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms