Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gabpb1Q00420 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms