Protein–RNA interactions for Protein: P97503

Nkx3-2, Homeobox protein Nkx-3.2, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx3-2P97503 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx3-2P97503 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx3-2P97503 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx3-2P97503 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx3-2P97503 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx3-2P97503 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx3-2P97503 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx3-2P97503 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx3-2P97503 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx3-2P97503 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx3-2P97503 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx3-2P97503 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx3-2P97503 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nkx3-2P97503 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx3-2P97503 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms