Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smyd1P97443 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smyd1P97443 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms