Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Taf1bP97358 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Taf1bP97358 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms