Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
H3f3aP84244 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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