Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx2P80206 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx2P80206 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otx2P80206 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otx2P80206 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Otx2P80206 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otx2P80206 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Otx2P80206 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Otx2P80206 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Otx2P80206 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otx2P80206 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Otx2P80206 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Otx2P80206 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Otx2P80206 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Otx2P80206 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otx2P80206 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Otx2P80206 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otx2P80206 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otx2P80206 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Otx2P80206 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otx2P80206 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otx2P80206 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Otx2P80206 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Otx2P80206 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms