Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Otx1P80205 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms