Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Polr1bP70700 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Polr1bP70700 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms