Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tp53bp1P70399 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tp53bp1P70399 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms