Protein–RNA interactions for Protein: P70390

Shox2, Short stature homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shox2P70390 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shox2P70390 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shox2P70390 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shox2P70390 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shox2P70390 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shox2P70390 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shox2P70390 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shox2P70390 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms