Protein–RNA interactions for Protein: P70340

Smad1, Mothers against decapentaplegic homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad1P70340 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad1P70340 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad1P70340 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad1P70340 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad1P70340 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad1P70340 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smad1P70340 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Smad1P70340 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad1P70340 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad1P70340 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Smad1P70340 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms