Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprvP70289 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprvP70289 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprvP70289 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprvP70289 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprvP70289 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprvP70289 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprvP70289 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprvP70289 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
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PtprvP70289 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PtprvP70289 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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PtprvP70289 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprvP70289 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprvP70289 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprvP70289 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprvP70289 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PtprvP70289 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms