Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rad54lP70270 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms