Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NfixP70257 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfixP70257 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfixP70257 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfixP70257 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfixP70257 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfixP70257 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NfixP70257 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfixP70257 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfixP70257 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfixP70257 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfixP70257 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfixP70257 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfixP70257 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NfixP70257 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfixP70257 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NfixP70257 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NfixP70257 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfixP70257 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfixP70257 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfixP70257 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfixP70257 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NfixP70257 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfixP70257 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfixP70257 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfixP70257 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfixP70257 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfixP70257 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NfixP70257 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfixP70257 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfixP70257 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfixP70257 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfixP70257 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfixP70257 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfixP70257 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NfixP70257 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfixP70257 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfixP70257 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfixP70257 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfixP70257 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfixP70257 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfixP70257 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NfixP70257 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfixP70257 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfixP70257 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfixP70257 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NfixP70257 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfixP70257 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfixP70257 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfixP70257 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfixP70257 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NfixP70257 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfixP70257 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfixP70257 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfixP70257 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfixP70257 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfixP70257 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfixP70257 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfixP70257 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfixP70257 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NfixP70257 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfixP70257 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfixP70257 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfixP70257 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfixP70257 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfixP70257 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfixP70257 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfixP70257 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfixP70257 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfixP70257 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NfixP70257 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NfixP70257 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
NfixP70257 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfixP70257 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfixP70257 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfixP70257 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfixP70257 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfixP70257 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfixP70257 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfixP70257 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NfixP70257 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NfixP70257 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NfixP70257 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NfixP70257 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NfixP70257 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NfixP70257 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NfixP70257 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NfixP70257 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NfixP70257 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NfixP70257 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NfixP70257 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
NfixP70257 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NfixP70257 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NfixP70257 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NfixP70257 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NfixP70257 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NfixP70257 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NfixP70257 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NfixP70257 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NfixP70257 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms