Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NficP70255 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NficP70255 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NficP70255 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NficP70255 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NficP70255 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NficP70255 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NficP70255 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NficP70255 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NficP70255 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NficP70255 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NficP70255 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NficP70255 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NficP70255 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NficP70255 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NficP70255 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NficP70255 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NficP70255 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NficP70255 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NficP70255 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NficP70255 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NficP70255 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NficP70255 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NficP70255 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NficP70255 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NficP70255 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NficP70255 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
NficP70255 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NficP70255 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NficP70255 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NficP70255 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NficP70255 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NficP70255 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NficP70255 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NficP70255 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NficP70255 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NficP70255 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NficP70255 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NficP70255 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NficP70255 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NficP70255 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NficP70255 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NficP70255 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NficP70255 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NficP70255 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NficP70255 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NficP70255 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NficP70255 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NficP70255 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NficP70255 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NficP70255 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NficP70255 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NficP70255 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NficP70255 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NficP70255 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NficP70255 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NficP70255 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NficP70255 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NficP70255 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NficP70255 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NficP70255 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NficP70255 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NficP70255 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NficP70255 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NficP70255 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NficP70255 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NficP70255 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NficP70255 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NficP70255 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NficP70255 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NficP70255 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NficP70255 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NficP70255 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NficP70255 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NficP70255 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NficP70255 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NficP70255 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NficP70255 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NficP70255 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NficP70255 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NficP70255 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NficP70255 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NficP70255 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NficP70255 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NficP70255 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NficP70255 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NficP70255 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NficP70255 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NficP70255 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NficP70255 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NficP70255 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NficP70255 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NficP70255 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NficP70255 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NficP70255 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NficP70255 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NficP70255 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NficP70255 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NficP70255 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NficP70255 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms