Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Hoxd13P70217 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Hoxd13P70217 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Hoxd13P70217 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Hoxd13P70217 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Hoxd13P70217 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Hoxd13P70217 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxd13P70217 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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