Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Traf5P70191 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Traf5P70191 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Traf5P70191 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Traf5P70191 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Traf5P70191 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Traf5P70191 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf5P70191 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf5P70191 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf5P70191 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf5P70191 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms