Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SbdsP70122 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SbdsP70122 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SbdsP70122 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SbdsP70122 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SbdsP70122 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SbdsP70122 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SbdsP70122 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SbdsP70122 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms