Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps28P62858 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Rps28P62858 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms