Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta2P62737 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta2P62737 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta2P62737 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta2P62737 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Acta2P62737 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms