Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snrpd1P62315 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms