Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
Rps29P62274 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Rps29P62274 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms