Protein–RNA interactions for Protein: P61358

Rpl27, 60S ribosomal protein L27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27P61358 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rpl27P61358 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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