Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nphp4P59240 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nphp4P59240 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms