Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup43P59235 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup43P59235 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup43P59235 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup43P59235 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup43P59235 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup43P59235 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup43P59235 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup43P59235 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms