Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Scarf2P59222 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Scarf2P59222 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms