Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NcstnP57716 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NcstnP57716 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NcstnP57716 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NcstnP57716 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NcstnP57716 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NcstnP57716 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NcstnP57716 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NcstnP57716 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms