Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn18P56857 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn18P56857 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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