Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd38P56528 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd38P56528 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd38P56528 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd38P56528 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd38P56528 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd38P56528 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cd38P56528 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd38P56528 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd38P56528 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd38P56528 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd38P56528 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd38P56528 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd38P56528 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd38P56528 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd38P56528 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd38P56528 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd38P56528 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cd38P56528 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd38P56528 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd38P56528 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd38P56528 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd38P56528 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd38P56528 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cd38P56528 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd38P56528 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd38P56528 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cd38P56528 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd38P56528 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cd38P56528 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd38P56528 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd38P56528 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd38P56528 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cd38P56528 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cd38P56528 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms