Protein–RNA interactions for Protein: P56382

Atp5e, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5eP56382 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Atp5eP56382 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms