Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtskP55097 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtskP55097 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtskP55097 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtskP55097 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtskP55097 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtskP55097 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtskP55097 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtskP55097 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtskP55097 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtskP55097 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtskP55097 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CtskP55097 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtskP55097 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtskP55097 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtskP55097 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtskP55097 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtskP55097 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtskP55097 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtskP55097 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CtskP55097 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtskP55097 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtskP55097 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtskP55097 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtskP55097 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtskP55097 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CtskP55097 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CtskP55097 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtskP55097 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtskP55097 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtskP55097 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtskP55097 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtskP55097 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtskP55097 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtskP55097 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtskP55097 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtskP55097 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CtskP55097 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtskP55097 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CtskP55097 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtskP55097 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtskP55097 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtskP55097 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtskP55097 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtskP55097 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtskP55097 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtskP55097 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtskP55097 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CtskP55097 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtskP55097 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtskP55097 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtskP55097 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtskP55097 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtskP55097 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CtskP55097 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtskP55097 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtskP55097 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtskP55097 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtskP55097 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtskP55097 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtskP55097 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtskP55097 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtskP55097 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtskP55097 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CtskP55097 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtskP55097 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtskP55097 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtskP55097 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtskP55097 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtskP55097 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtskP55097 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtskP55097 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtskP55097 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtskP55097 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtskP55097 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtskP55097 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtskP55097 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtskP55097 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtskP55097 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtskP55097 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtskP55097 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtskP55097 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtskP55097 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtskP55097 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtskP55097 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtskP55097 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtskP55097 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtskP55097 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtskP55097 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtskP55097 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtskP55097 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtskP55097 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtskP55097 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtskP55097 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CtskP55097 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CtskP55097 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CtskP55097 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtskP55097 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtskP55097 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtskP55097 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms